藥物基因組學旨在揭示個體遺傳變異對藥物反應的影響，實現個體化用藥。熒光定量PCR（qPCR）技術憑借其高靈敏度、特異性和實時性，已成為PGx研究中基因分型、表達分析及突變檢測的核心工具。

一、藥物基因組學研究的核心挑戰與技術需求

藥物療效和毒性的個體差異往往源于藥物代謝酶（如CYP450家族）、轉運蛋白（如ABCB1）及藥物靶點（如EGFR）的基因多態性。傳統方法如一代測序通量低、周期長，而基因芯片成本高且靈活性不足，難以滿足大規模、動態的PGx研究需求。熒光定量PCR技術的出現為解決這些問題提供了理想方案：

高靈敏度：可檢測單拷貝起始模板及低豐度 RNA，適用于血液、組織等微量樣本。

實時監測：通過熒光信號動態跟蹤PCR擴增，結合熔解曲線（HRM）或探針法實現SNP基因分型及突變掃描。

多重檢測能力：單次反應可同時分析多個基因位點（如CYP2D6、CYP2C19多態性），顯著提升實驗效率。

定量準確性：借助標準曲線法或ΔΔCt相對定量，精確評估基因表達水平與藥物代謝關聯。

二、QPCR平臺在藥物基因組學中的典型應用場景

（一）藥物代謝酶基因多態性分型

針對CYP2D6、CYP2C19等關鍵代謝酶基因的 SNP（如CYP2D610、CYP2C93），利用TaqMan探針法結合雙通道檢測：

實驗設計：單管內同時標記野生型（VIC）與突變型（FAM）探針，ROX通道校正移液誤差。

數據價值：快速區分超快/慢代謝基因型，指導抗抑郁藥（如氟西?。?、抗凝藥（如華法林）的個體化劑量調整，減少不良反應風險。

（二）藥物轉運體與靶點基因表達分析

通過SYBR Green染料法或逆轉錄qPCR（RT-qPCR）監測基因表達變化：

他汀類藥物反應預測：檢測SLCO1B1基因表達水平，結合ABCB1多態性數據，評估藥物在肝臟攝取與外排的個體差異，優化降脂治療方案。

技術優勢：雙通道同步檢測目標基因與內參（如GAPDH），HRM熔解曲線驗證擴增特異性，確保表達量數據的可靠性。

（三）耐藥基因與生物標志物發現

在腫瘤或感染性疾病PGx研究中：

突變掃描：HRM分析ctDNA中的EGFR/T790M耐藥突變，或結核分枝桿菌rpoB基因突變，輔助靶向治療決策。

高通量篩查：多重qPCR panel同時檢測多個耐藥相關基因（如HIV蛋白酶抑制劑靶點多態），適配臨床樣本的快速診斷需求。

三、實驗設計與質量控制要點

引物與探針優化：基于NCBI數據庫設計覆蓋多態位點的特異性引物，通過預實驗驗證擴增效率（E%=85–110%）及熔解曲線單峰性。

嚴格對照設置：包含陽性質控（已知基因型樣本）、陰性質控（無模板對照）及重復性驗證（復孔RSD≤3%），確保數據可追溯性。

跨平臺兼容性驗證：對比Sanger測序或芯片結果校準分型準確性，尤其針對低頻變異（MAF<5%）的檢出能力評估。

臨床樣本處理規范：遵循RNA/DNA提取標準化流程（OD260/280=1.8–2.1），避免RNase污染影響RT-qPCR檢測精度。

四、展望：QPCR技術推動PGx研究

博清生物科技（南京）有限公司研發的熒光定量PCR儀憑借其高精度溫控、靈活檢測模式及成本效益優勢，為藥物基因組學提供了從實驗室研究到臨床應用的高效工具鏈：

加速新藥研發：在藥物臨床試驗中實時監測候選藥物對代謝酶/轉運體基因的調控，優化劑量爬坡方案與生物標志物發現。

支撐精準醫療落地：基層醫療機構可借助該平臺開展常見PGx檢測（如高血壓用藥相關基因panel），推動個體化用藥普及。

賦能多組學整合研究：與基因組測序、蛋白質組學數據聯動，解析遺傳-表觀-代謝網絡對藥物反應的協同影響，開拓PGx研究新維度。

熒光定量PCR技術是連接基因變異與藥物反應表型的關鍵橋梁，而博清生物科技（南京）有限公司研發的QPCR平臺通過精密的工程設計與用戶導向功能，顯著提升了藥物基因組學研究的效率、準確性與可及性。隨著PGx臨床指南（如CPIC、DPWG）的不斷完善及個體化用藥需求增長，博清生物科技（南京）有限公司將持續助力科研人員突破技術瓶頸，推動精準醫學從理論走向實踐，最終惠及患者的治療獲益。